Пока SG-1 пытаются уничтожить Баала, последнего повелителя гуаулдов, Тилк и Вала таинственно исчезают. Картер, Дэниел и Митчелл понимают, что временной континуум нарушен, а программа исследования звездных врат стерта из истории. Герои пытаются донести свою сложную идею до властей, но на орбите появляются крейсеры гоаулдов, возглавляемые Баалом, королевой Катеш и премьер-министром Тилком. SG-1 должны найти Звездные врата и восстановить правильный ход событий, прежде чем мир будет порабощен

Команда SG-1 начинает поиски артефакта, Ковчега Истины, способного победить вражескую армию. Вскоре герои узнают о существовании суперврат, через которые Орай хотят отправить свою армаду на Землю для полного уничтожения. Устройство находится в родной галактике Орай, и SG-1 отправляется туда, чтобы упредить атаку. Но у Комитета по ассигнованиям свои планы, и SG-1 оказывается в далекой галактике между двумя могущественными врагами.